Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NESP48681 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NESP48681 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NESP48681 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NESP48681 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NESP48681 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NESP48681 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NESP48681 CALML6-201ENST00000307786 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NESP48681 UCN3-201ENST00000380433 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NESP48681 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NESP48681 KCNK15-AS1-203ENST00000427598 862 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NESP48681 RPL18AP15-201ENST00000430258 517 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NESP48681 AC103563.2-201ENST00000442200 597 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NESP48681 AC024405.2-201ENST00000528459 810 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NESP48681 PRR20FP-201ENST00000603320 180 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NESP48681 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NESP48681 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NESP48681 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NESP48681 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NESP48681 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NESP48681 SULT1A2-202ENST00000395630 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NESP48681 RPL4P6-201ENST00000438116 1304 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NESP48681 TUBAL3-201ENST00000380419 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NESP48681 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NESP48681 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NESP48681 CFL1P6-201ENST00000400899 494 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NESP48681 RN7SKP212-201ENST00000410851 328 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NESP48681 AC011284.1-201ENST00000427920 856 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NESP48681 TCL1A-209ENST00000557043 980 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NESP48681 Z82244.2-201ENST00000632196 448 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NESP48681 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NESP48681 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NESP48681 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NESP48681 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NESP48681 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NESP48681 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NESP48681 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NESP48681 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NESP48681 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NESP48681 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NESP48681 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NESP48681 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NESP48681 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NESP48681 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NESP48681 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NESP48681 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NESP48681 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NESP48681 TPPP3-205ENST00000564104 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NESP48681 RIBC1-202ENST00000375327 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NESP48681 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NESP48681 OR2T8-201ENST00000319968 939 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NESP48681 NR1I3-201ENST00000367979 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NESP48681 NR1I3-207ENST00000367985 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NESP48681 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NESP48681 KRT18P33-201ENST00000398525 1043 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NESP48681 SEPT7-AS1-201ENST00000412856 587 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NESP48681 AL359092.2-201ENST00000423330 585 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NESP48681 AL022332.1-202ENST00000432495 426 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NESP48681 TMA16-204ENST00000508268 608 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NESP48681 NR1I3-225ENST00000508387 634 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NESP48681 AC138627.1-201ENST00000641127 1257 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NESP48681 OR2T8-202ENST00000641945 1226 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NESP48681 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NESP48681 DAP3-201ENST00000343043 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NESP48681 OASL-202ENST00000339275 1492 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NESP48681 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NESP48681 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NESP48681 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NESP48681 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NESP48681 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NESP48681 CCL17-201ENST00000219244 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NESP48681 DHRS7C-201ENST00000330255 1006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NESP48681 AC013436.1-201ENST00000425077 422 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NESP48681 GHRL-206ENST00000430179 856 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NESP48681 PGK1P2-201ENST00000431702 1214 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NESP48681 TRAPPC4-202ENST00000434101 794 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NESP48681 SPRY4-AS1-206ENST00000515288 539 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NESP48681 SLC13A2-205ENST00000545060 1276 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NESP48681 AL512356.1-201ENST00000548203 535 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NESP48681 CDC37P2-201ENST00000562287 1029 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NESP48681 ZNF235-203ENST00000589248 532 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NESP48681 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NESP48681 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NESP48681 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NESP48681 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NESP48681 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NESP48681 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NESP48681 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NESP48681 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NESP48681 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NESP48681 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NESP48681 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NESP48681 RPL10L-201ENST00000298283 812 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NESP48681 HCRTR1-201ENST00000373705 1170 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NESP48681 PCLAF-202ENST00000380258 911 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NESP48681 CDRT15L2-201ENST00000399044 1048 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NESP48681 TPT1P9-201ENST00000413759 514 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NESP48681 YY1P2-201ENST00000438766 948 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NESP48681 MARK2P17-201ENST00000498560 841 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NESP48681 TBC1D3P6-201ENST00000505954 962 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms