Protein–RNA interactions for Protein: P39086

GRIK1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK1P39086 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIK1P39086 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms