Protein–RNA interactions for Protein: P35221

CTNNA1, Catenin alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA1P35221 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CTNNA1P35221 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CTNNA1P35221 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CTNNA1P35221 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CTNNA1P35221 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CTNNA1P35221 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CTNNA1P35221 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CTNNA1P35221 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CTNNA1P35221 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CTNNA1P35221 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTNNA1P35221 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTNNA1P35221 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTNNA1P35221 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTNNA1P35221 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTNNA1P35221 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTNNA1P35221 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTNNA1P35221 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CTNNA1P35221 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTNNA1P35221 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTNNA1P35221 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTNNA1P35221 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTNNA1P35221 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTNNA1P35221 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTNNA1P35221 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTNNA1P35221 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTNNA1P35221 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTNNA1P35221 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTNNA1P35221 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTNNA1P35221 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTNNA1P35221 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTNNA1P35221 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTNNA1P35221 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTNNA1P35221 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTNNA1P35221 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTNNA1P35221 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CTNNA1P35221 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTNNA1P35221 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTNNA1P35221 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTNNA1P35221 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTNNA1P35221 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTNNA1P35221 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CTNNA1P35221 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTNNA1P35221 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTNNA1P35221 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTNNA1P35221 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTNNA1P35221 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTNNA1P35221 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTNNA1P35221 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTNNA1P35221 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTNNA1P35221 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTNNA1P35221 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTNNA1P35221 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTNNA1P35221 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTNNA1P35221 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTNNA1P35221 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTNNA1P35221 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTNNA1P35221 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTNNA1P35221 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTNNA1P35221 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTNNA1P35221 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CTNNA1P35221 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CTNNA1P35221 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTNNA1P35221 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTNNA1P35221 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTNNA1P35221 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTNNA1P35221 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTNNA1P35221 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTNNA1P35221 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTNNA1P35221 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTNNA1P35221 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTNNA1P35221 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTNNA1P35221 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTNNA1P35221 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTNNA1P35221 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTNNA1P35221 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTNNA1P35221 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTNNA1P35221 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTNNA1P35221 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTNNA1P35221 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CTNNA1P35221 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms