Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 IGHEP2-201ENST00000519308 1256 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
POLD1P28340 LINC00824-204ENST00000520766 597 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLD1P28340 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLD1P28340 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLD1P28340 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLD1P28340 NMRK2-202ENST00000593949 869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLD1P28340 NMRK2-204ENST00000599576 691 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLD1P28340 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
POLD1P28340 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLD1P28340 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLD1P28340 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLD1P28340 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLD1P28340 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLD1P28340 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLD1P28340 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLD1P28340 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLD1P28340 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLD1P28340 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLD1P28340 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
POLD1P28340 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
POLD1P28340 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
POLD1P28340 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
POLD1P28340 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
POLD1P28340 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
POLD1P28340 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
POLD1P28340 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLD1P28340 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLD1P28340 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLD1P28340 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLD1P28340 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLD1P28340 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLD1P28340 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
POLD1P28340 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLD1P28340 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLD1P28340 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
POLD1P28340 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLD1P28340 KRT18P4-201ENST00000422599 1288 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
POLD1P28340 AC107464.2-201ENST00000502923 569 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLD1P28340 IKBKB-223ENST00000522147 954 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLD1P28340 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
POLD1P28340 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLD1P28340 RPL18-205ENST00000549273 1036 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLD1P28340 TNFRSF12A-204ENST00000573001 648 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLD1P28340 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLD1P28340 CR392039.1-201ENST00000623217 204 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
POLD1P28340 LINC01002-234ENST00000633808 848 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLD1P28340 GNG14-201ENST00000640117 210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLD1P28340 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLD1P28340 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLD1P28340 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLD1P28340 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLD1P28340 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLD1P28340 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLD1P28340 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLD1P28340 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLD1P28340 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLD1P28340 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLD1P28340 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLD1P28340 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLD1P28340 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLD1P28340 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLD1P28340 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
POLD1P28340 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLD1P28340 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLD1P28340 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLD1P28340 BTNL8-203ENST00000400707 1512 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLD1P28340 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLD1P28340 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLD1P28340 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLD1P28340 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLD1P28340 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLD1P28340 SERPINA1-209ENST00000449399 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLD1P28340 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLD1P28340 CMIP-202ENST00000537098 4357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLD1P28340 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLD1P28340 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLD1P28340 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLD1P28340 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLD1P28340 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLD1P28340 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLD1P28340 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLD1P28340 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLD1P28340 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLD1P28340 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLD1P28340 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLD1P28340 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLD1P28340 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLD1P28340 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLD1P28340 S100A13-203ENST00000392623 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLD1P28340 LINC00339-202ENST00000416769 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLD1P28340 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
POLD1P28340 KRT8P30-201ENST00000432100 650 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
POLD1P28340 AC093609.1-201ENST00000434020 952 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLD1P28340 AC128689.1-202ENST00000459861 827 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLD1P28340 CD300LF-206ENST00000464910 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLD1P28340 IGKV1D-43-201ENST00000468879 532 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLD1P28340 AC087071.1-201ENST00000469264 427 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLD1P28340 RORA-AS1-201ENST00000501579 761 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLD1P28340 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
POLD1P28340 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms