Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO2P25791 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO2P25791 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO2P25791 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO2P25791 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO2P25791 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO2P25791 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO2P25791 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO2P25791 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO2P25791 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO2P25791 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO2P25791 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO2P25791 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO2P25791 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO2P25791 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO2P25791 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO2P25791 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO2P25791 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO2P25791 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO2P25791 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO2P25791 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO2P25791 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO2P25791 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO2P25791 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO2P25791 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO2P25791 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO2P25791 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO2P25791 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO2P25791 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LMO2P25791 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO2P25791 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO2P25791 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO2P25791 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO2P25791 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO2P25791 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO2P25791 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO2P25791 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO2P25791 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO2P25791 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO2P25791 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO2P25791 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO2P25791 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO2P25791 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO2P25791 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO2P25791 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO2P25791 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO2P25791 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO2P25791 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO2P25791 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO2P25791 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO2P25791 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO2P25791 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO2P25791 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO2P25791 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO2P25791 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO2P25791 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO2P25791 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO2P25791 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO2P25791 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO2P25791 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO2P25791 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO2P25791 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO2P25791 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO2P25791 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO2P25791 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO2P25791 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO2P25791 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO2P25791 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO2P25791 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO2P25791 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO2P25791 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO2P25791 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO2P25791 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO2P25791 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO2P25791 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO2P25791 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO2P25791 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO2P25791 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO2P25791 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO2P25791 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO2P25791 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO2P25791 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO2P25791 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO2P25791 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO2P25791 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO2P25791 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LMO2P25791 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LMO2P25791 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LMO2P25791 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LMO2P25791 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LMO2P25791 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LMO2P25791 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LMO2P25791 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LMO2P25791 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LMO2P25791 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LMO2P25791 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LMO2P25791 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LMO2P25791 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LMO2P25791 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LMO2P25791 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms