Protein–RNA interactions for Protein: P19875

CXCL2, C-X-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL2P19875 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
CXCL2P19875 AC144450.1-201ENST00000366424 1641 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
CXCL2P19875 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 RRBP1-206ENST00000455029 2485 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 VHL-201ENST00000256474 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 HERPUD1-204ENST00000439977 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 AL355102.3-201ENST00000554299 1678 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 AC021218.1-201ENST00000377722 2536 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 AC016730.1-201ENST00000420828 832 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC12.27□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC12.27□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 MSH6-214ENST00000616033 3429 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 SLC26A6-205ENST00000395550 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 AC036108.2-201ENST00000566974 2562 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 TRIM3-203ENST00000525074 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 TMEM233-201ENST00000426426 3081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 TPO-202ENST00000345913 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 DPP8-204ENST00000358939 2822 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 NCDN-201ENST00000356090 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 FAM212B-AS1-201ENST00000430373 2131 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 SAP30BP-225ENST00000584667 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 RIPK4-201ENST00000332512 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 PRPF40B-209ENST00000548825 3307 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 VSTM2A-201ENST00000302287 3401 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 NAGK-202ENST00000418807 2343 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 LINC02015-202ENST00000436078 2957 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 EPS15L1-202ENST00000455140 3266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 AL021155.1-201ENST00000438808 2637 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 FAM90A11P-201ENST00000518378 2218 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 PIP5K1A-204ENST00000409426 3737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 SH3TC1-201ENST00000245105 4226 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 BCAS3-221ENST00000588874 2948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CXCL2P19875 IFT172-203ENST00000416524 1982 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms