Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRIM21P19474 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.4 ms