Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEFHP12036 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEFHP12036 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEFHP12036 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEFHP12036 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NEFHP12036 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEFHP12036 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEFHP12036 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NEFHP12036 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEFHP12036 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEFHP12036 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEFHP12036 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEFHP12036 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEFHP12036 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEFHP12036 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEFHP12036 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEFHP12036 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEFHP12036 ABCA2-202ENST00000341511 8063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEFHP12036 TRPM2-201ENST00000300481 5627 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEFHP12036 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEFHP12036 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEFHP12036 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEFHP12036 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NEFHP12036 CACNA1G-207ENST00000429973 7120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEFHP12036 CACNA1G-217ENST00000507336 7116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEFHP12036 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEFHP12036 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEFHP12036 AR-208ENST00000612452 10676 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEFHP12036 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEFHP12036 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NEFHP12036 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEFHP12036 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEFHP12036 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEFHP12036 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEFHP12036 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEFHP12036 MIER2-201ENST00000264819 6884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEFHP12036 SMU1-201ENST00000397149 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEFHP12036 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEFHP12036 MECOM-206ENST00000464456 5732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEFHP12036 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEFHP12036 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEFHP12036 ENTPD4-202ENST00000358689 5861 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEFHP12036 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEFHP12036 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEFHP12036 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEFHP12036 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEFHP12036 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NEFHP12036 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NEFHP12036 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NEFHP12036 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NEFHP12036 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEFHP12036 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEFHP12036 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NEFHP12036 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEFHP12036 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEFHP12036 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NEFHP12036 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEFHP12036 WTIP-202ENST00000590071 13665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEFHP12036 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEFHP12036 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEFHP12036 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEFHP12036 TBC1D24-201ENST00000293970 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEFHP12036 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEFHP12036 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEFHP12036 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEFHP12036 STRIP2-201ENST00000249344 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEFHP12036 MYT1-201ENST00000328439 5535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NEFHP12036 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEFHP12036 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEFHP12036 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEFHP12036 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEFHP12036 IGFN1-201ENST00000295591 4439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEFHP12036 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEFHP12036 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEFHP12036 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEFHP12036 TP53INP2-202ENST00000374810 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEFHP12036 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEFHP12036 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEFHP12036 TMEM131L-203ENST00000409959 5017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEFHP12036 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEFHP12036 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEFHP12036 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEFHP12036 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEFHP12036 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEFHP12036 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEFHP12036 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEFHP12036 BRWD1-204ENST00000380800 7605 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEFHP12036 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEFHP12036 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEFHP12036 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEFHP12036 PARD6B-201ENST00000371610 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEFHP12036 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEFHP12036 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEFHP12036 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEFHP12036 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEFHP12036 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEFHP12036 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEFHP12036 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEFHP12036 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NEFHP12036 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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