Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 GAB1-202ENST00000262995 7981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TMEM225BP0DP42 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms