Protein–RNA interactions for Protein: F8W1W9

NPIPB9, Nuclear pore complex-interacting protein family member B9, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB9F8W1W9 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NPIPB9F8W1W9 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NPIPB9F8W1W9 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NPIPB9F8W1W9 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NPIPB9F8W1W9 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NPIPB9F8W1W9 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NPIPB9F8W1W9 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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NPIPB9F8W1W9 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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NPIPB9F8W1W9 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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NPIPB9F8W1W9 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
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NPIPB9F8W1W9 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NPIPB9F8W1W9 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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NPIPB9F8W1W9 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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NPIPB9F8W1W9 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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NPIPB9F8W1W9 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NPIPB9F8W1W9 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NPIPB9F8W1W9 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NPIPB9F8W1W9 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NPIPB9F8W1W9 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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NPIPB9F8W1W9 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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NPIPB9F8W1W9 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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NPIPB9F8W1W9 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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NPIPB9F8W1W9 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NPIPB9F8W1W9 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NPIPB9F8W1W9 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NPIPB9F8W1W9 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NPIPB9F8W1W9 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NPIPB9F8W1W9 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NPIPB9F8W1W9 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NPIPB9F8W1W9 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NPIPB9F8W1W9 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NPIPB9F8W1W9 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NPIPB9F8W1W9 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
NPIPB9F8W1W9 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NPIPB9F8W1W9 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NPIPB9F8W1W9 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NPIPB9F8W1W9 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NPIPB9F8W1W9 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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