Protein–RNA interactions for Protein: C9JLJ4

USP17L13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L13C9JLJ4 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
USP17L13C9JLJ4 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
USP17L13C9JLJ4 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
USP17L13C9JLJ4 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
USP17L13C9JLJ4 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
USP17L13C9JLJ4 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP17L13C9JLJ4 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP17L13C9JLJ4 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP17L13C9JLJ4 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP17L13C9JLJ4 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP17L13C9JLJ4 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP17L13C9JLJ4 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP17L13C9JLJ4 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP17L13C9JLJ4 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP17L13C9JLJ4 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP17L13C9JLJ4 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP17L13C9JLJ4 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP17L13C9JLJ4 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP17L13C9JLJ4 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP17L13C9JLJ4 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP17L13C9JLJ4 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP17L13C9JLJ4 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP17L13C9JLJ4 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP17L13C9JLJ4 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP17L13C9JLJ4 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP17L13C9JLJ4 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP17L13C9JLJ4 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP17L13C9JLJ4 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
USP17L13C9JLJ4 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP17L13C9JLJ4 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP17L13C9JLJ4 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP17L13C9JLJ4 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
USP17L13C9JLJ4 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP17L13C9JLJ4 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP17L13C9JLJ4 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP17L13C9JLJ4 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP17L13C9JLJ4 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
USP17L13C9JLJ4 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
USP17L13C9JLJ4 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP17L13C9JLJ4 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
USP17L13C9JLJ4 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP17L13C9JLJ4 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
USP17L13C9JLJ4 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP17L13C9JLJ4 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP17L13C9JLJ4 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP17L13C9JLJ4 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP17L13C9JLJ4 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP17L13C9JLJ4 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP17L13C9JLJ4 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP17L13C9JLJ4 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP17L13C9JLJ4 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP17L13C9JLJ4 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP17L13C9JLJ4 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP17L13C9JLJ4 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
USP17L13C9JLJ4 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP17L13C9JLJ4 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP17L13C9JLJ4 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
USP17L13C9JLJ4 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP17L13C9JLJ4 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP17L13C9JLJ4 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP17L13C9JLJ4 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP17L13C9JLJ4 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP17L13C9JLJ4 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
USP17L13C9JLJ4 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
USP17L13C9JLJ4 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
USP17L13C9JLJ4 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
USP17L13C9JLJ4 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
USP17L13C9JLJ4 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
USP17L13C9JLJ4 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
USP17L13C9JLJ4 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
USP17L13C9JLJ4 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
USP17L13C9JLJ4 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
USP17L13C9JLJ4 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
USP17L13C9JLJ4 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
USP17L13C9JLJ4 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
USP17L13C9JLJ4 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
USP17L13C9JLJ4 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
USP17L13C9JLJ4 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
USP17L13C9JLJ4 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
USP17L13C9JLJ4 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
USP17L13C9JLJ4 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
USP17L13C9JLJ4 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
USP17L13C9JLJ4 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
USP17L13C9JLJ4 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
USP17L13C9JLJ4 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
USP17L13C9JLJ4 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
USP17L13C9JLJ4 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
USP17L13C9JLJ4 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
USP17L13C9JLJ4 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
USP17L13C9JLJ4 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
USP17L13C9JLJ4 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
USP17L13C9JLJ4 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
USP17L13C9JLJ4 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
USP17L13C9JLJ4 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
USP17L13C9JLJ4 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
USP17L13C9JLJ4 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
USP17L13C9JLJ4 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
USP17L13C9JLJ4 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
USP17L13C9JLJ4 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
USP17L13C9JLJ4 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms