Protein–RNA interactions for Protein: A0AVI4

TMEM129, E3 ubiquitin-protein ligase TM129, humanhuman

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Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM129A0AVI4 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM129A0AVI4 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM129A0AVI4 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM129A0AVI4 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM129A0AVI4 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM129A0AVI4 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM129A0AVI4 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM129A0AVI4 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM129A0AVI4 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM129A0AVI4 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM129A0AVI4 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM129A0AVI4 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM129A0AVI4 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM129A0AVI4 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM129A0AVI4 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM129A0AVI4 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM129A0AVI4 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM129A0AVI4 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM129A0AVI4 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM129A0AVI4 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM129A0AVI4 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM129A0AVI4 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM129A0AVI4 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM129A0AVI4 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM129A0AVI4 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM129A0AVI4 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM129A0AVI4 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM129A0AVI4 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM129A0AVI4 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM129A0AVI4 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM129A0AVI4 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM129A0AVI4 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM129A0AVI4 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM129A0AVI4 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM129A0AVI4 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM129A0AVI4 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TMEM129A0AVI4 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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TMEM129A0AVI4 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM129A0AVI4 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM129A0AVI4 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM129A0AVI4 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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TMEM129A0AVI4 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM129A0AVI4 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM129A0AVI4 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM129A0AVI4 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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TMEM129A0AVI4 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM129A0AVI4 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM129A0AVI4 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM129A0AVI4 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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TMEM129A0AVI4 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM129A0AVI4 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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TMEM129A0AVI4 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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TMEM129A0AVI4 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TMEM129A0AVI4 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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TMEM129A0AVI4 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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TMEM129A0AVI4 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM129A0AVI4 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM129A0AVI4 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM129A0AVI4 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM129A0AVI4 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM129A0AVI4 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM129A0AVI4 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM129A0AVI4 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TMEM129A0AVI4 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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