Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC11.16□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC11.16□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC11.16□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC11.16□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
DKK2Q9UBU2 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms