Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N2

ARHGAP28, Rho GTPase-activating protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP28Q9P2N2 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ARHGAP28Q9P2N2 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARHGAP28Q9P2N2 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARHGAP28Q9P2N2 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARHGAP28Q9P2N2 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARHGAP28Q9P2N2 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARHGAP28Q9P2N2 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARHGAP28Q9P2N2 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARHGAP28Q9P2N2 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARHGAP28Q9P2N2 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARHGAP28Q9P2N2 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARHGAP28Q9P2N2 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARHGAP28Q9P2N2 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARHGAP28Q9P2N2 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARHGAP28Q9P2N2 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARHGAP28Q9P2N2 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARHGAP28Q9P2N2 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARHGAP28Q9P2N2 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ARHGAP28Q9P2N2 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ARHGAP28Q9P2N2 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARHGAP28Q9P2N2 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARHGAP28Q9P2N2 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARHGAP28Q9P2N2 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ARHGAP28Q9P2N2 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ARHGAP28Q9P2N2 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARHGAP28Q9P2N2 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARHGAP28Q9P2N2 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ARHGAP28Q9P2N2 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ARHGAP28Q9P2N2 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARHGAP28Q9P2N2 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARHGAP28Q9P2N2 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ARHGAP28Q9P2N2 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARHGAP28Q9P2N2 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARHGAP28Q9P2N2 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARHGAP28Q9P2N2 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARHGAP28Q9P2N2 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARHGAP28Q9P2N2 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARHGAP28Q9P2N2 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARHGAP28Q9P2N2 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARHGAP28Q9P2N2 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARHGAP28Q9P2N2 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARHGAP28Q9P2N2 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARHGAP28Q9P2N2 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARHGAP28Q9P2N2 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARHGAP28Q9P2N2 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARHGAP28Q9P2N2 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARHGAP28Q9P2N2 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARHGAP28Q9P2N2 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARHGAP28Q9P2N2 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARHGAP28Q9P2N2 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARHGAP28Q9P2N2 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ARHGAP28Q9P2N2 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARHGAP28Q9P2N2 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARHGAP28Q9P2N2 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARHGAP28Q9P2N2 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARHGAP28Q9P2N2 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARHGAP28Q9P2N2 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARHGAP28Q9P2N2 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARHGAP28Q9P2N2 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARHGAP28Q9P2N2 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ARHGAP28Q9P2N2 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARHGAP28Q9P2N2 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARHGAP28Q9P2N2 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ARHGAP28Q9P2N2 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ARHGAP28Q9P2N2 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ARHGAP28Q9P2N2 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARHGAP28Q9P2N2 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARHGAP28Q9P2N2 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARHGAP28Q9P2N2 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARHGAP28Q9P2N2 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARHGAP28Q9P2N2 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARHGAP28Q9P2N2 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ARHGAP28Q9P2N2 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARHGAP28Q9P2N2 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARHGAP28Q9P2N2 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms