Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW7

SYT17, Synaptotagmin-17, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT17Q9BSW7 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYT17Q9BSW7 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYT17Q9BSW7 KRTAP12-2-201ENST00000360770 739 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYT17Q9BSW7 IFITM1-202ENST00000408968 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYT17Q9BSW7 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SYT17Q9BSW7 AL627095.1-201ENST00000414775 321 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SYT17Q9BSW7 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYT17Q9BSW7 AL137078.1-201ENST00000446280 404 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYT17Q9BSW7 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SYT17Q9BSW7 AC093300.1-201ENST00000510368 1201 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SYT17Q9BSW7 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SYT17Q9BSW7 AC117834.1-201ENST00000523197 602 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYT17Q9BSW7 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYT17Q9BSW7 EEF1AKMT3-203ENST00000548256 561 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYT17Q9BSW7 AL445363.2-201ENST00000554608 837 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYT17Q9BSW7 LIMD2-210ENST00000582055 509 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYT17Q9BSW7 LINC02081-201ENST00000586185 877 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYT17Q9BSW7 AL445363.1-201ENST00000623749 952 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYT17Q9BSW7 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYT17Q9BSW7 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYT17Q9BSW7 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYT17Q9BSW7 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYT17Q9BSW7 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYT17Q9BSW7 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYT17Q9BSW7 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYT17Q9BSW7 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SYT17Q9BSW7 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYT17Q9BSW7 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYT17Q9BSW7 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYT17Q9BSW7 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYT17Q9BSW7 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYT17Q9BSW7 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYT17Q9BSW7 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYT17Q9BSW7 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYT17Q9BSW7 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYT17Q9BSW7 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYT17Q9BSW7 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYT17Q9BSW7 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYT17Q9BSW7 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYT17Q9BSW7 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYT17Q9BSW7 SPAG1-205ENST00000520508 1796 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYT17Q9BSW7 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYT17Q9BSW7 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYT17Q9BSW7 PSMC5-201ENST00000310144 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYT17Q9BSW7 CFAP36-204ENST00000406691 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYT17Q9BSW7 CFAP20-201ENST00000262498 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYT17Q9BSW7 AC106785.2-201ENST00000564385 1319 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SYT17Q9BSW7 MRPL48-203ENST00000398483 1058 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYT17Q9BSW7 KCNE1-202ENST00000399284 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYT17Q9BSW7 AL353658.1-201ENST00000436263 789 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYT17Q9BSW7 RNF7-205ENST00000480908 782 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYT17Q9BSW7 IQSEC2-205ENST00000498281 673 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYT17Q9BSW7 WWC2-208ENST00000508747 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYT17Q9BSW7 RORA-AS1-202ENST00000558140 869 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYT17Q9BSW7 MT3-202ENST00000561640 514 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYT17Q9BSW7 MIR5193-201ENST00000584510 109 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SYT17Q9BSW7 PAX6-237ENST00000638696 1203 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYT17Q9BSW7 PAX6-238ENST00000638755 1161 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYT17Q9BSW7 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYT17Q9BSW7 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYT17Q9BSW7 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SYT17Q9BSW7 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYT17Q9BSW7 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYT17Q9BSW7 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYT17Q9BSW7 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYT17Q9BSW7 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYT17Q9BSW7 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYT17Q9BSW7 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
SYT17Q9BSW7 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SYT17Q9BSW7 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SYT17Q9BSW7 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SYT17Q9BSW7 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SYT17Q9BSW7 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SYT17Q9BSW7 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SYT17Q9BSW7 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SYT17Q9BSW7 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SYT17Q9BSW7 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SYT17Q9BSW7 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SYT17Q9BSW7 PDCD6-201ENST00000264933 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SYT17Q9BSW7 POLR2G-201ENST00000301788 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SYT17Q9BSW7 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SYT17Q9BSW7 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SYT17Q9BSW7 COA6-203ENST00000366615 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SYT17Q9BSW7 CHCHD1-202ENST00000372837 1202 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SYT17Q9BSW7 BPIFA4P-201ENST00000375465 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SYT17Q9BSW7 TMEM14B-201ENST00000379530 787 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SYT17Q9BSW7 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SYT17Q9BSW7 GHRL-206ENST00000430179 856 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SYT17Q9BSW7 HNRNPA1P59-201ENST00000430583 918 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SYT17Q9BSW7 AC005042.2-201ENST00000449526 510 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SYT17Q9BSW7 AL359219.1-201ENST00000556311 934 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SYT17Q9BSW7 INCA1-204ENST00000576820 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SYT17Q9BSW7 BOLA3P2-201ENST00000586496 323 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SYT17Q9BSW7 ZNF235-203ENST00000589248 532 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SYT17Q9BSW7 EMP3-204ENST00000596315 761 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SYT17Q9BSW7 AC005609.5-201ENST00000624712 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SYT17Q9BSW7 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SYT17Q9BSW7 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SYT17Q9BSW7 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SYT17Q9BSW7 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
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