Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 MIR3908-201ENST00000579798 126 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 AKR1C8P-201ENST00000578467 2182 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 GPC4-201ENST00000370828 4960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 LINC00894-206ENST00000450989 2361 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 TCAF2-201ENST00000357344 2958 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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SPOCK3Q9BQ16 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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SPOCK3Q9BQ16 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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SPOCK3Q9BQ16 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
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SPOCK3Q9BQ16 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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SPOCK3Q9BQ16 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 DUSP16-201ENST00000228862 3402 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SPOCK3Q9BQ16 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SPOCK3Q9BQ16 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
SPOCK3Q9BQ16 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SPOCK3Q9BQ16 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SPOCK3Q9BQ16 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SPOCK3Q9BQ16 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SPOCK3Q9BQ16 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SPOCK3Q9BQ16 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SPOCK3Q9BQ16 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
SPOCK3Q9BQ16 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
SPOCK3Q9BQ16 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
SPOCK3Q9BQ16 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SPOCK3Q9BQ16 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SPOCK3Q9BQ16 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SPOCK3Q9BQ16 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
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