Protein–RNA interactions for Protein: Q96JC1

VPS39, Vam6/Vps39-like protein, humanhuman

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Length 886 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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VPS39Q96JC1 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VPS39Q96JC1 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VPS39Q96JC1 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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VPS39Q96JC1 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
VPS39Q96JC1 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
VPS39Q96JC1 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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VPS39Q96JC1 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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VPS39Q96JC1 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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VPS39Q96JC1 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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VPS39Q96JC1 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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VPS39Q96JC1 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VPS39Q96JC1 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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VPS39Q96JC1 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VPS39Q96JC1 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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VPS39Q96JC1 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VPS39Q96JC1 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
VPS39Q96JC1 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VPS39Q96JC1 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VPS39Q96JC1 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VPS39Q96JC1 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VPS39Q96JC1 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
VPS39Q96JC1 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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