Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LTV1Q96GA3 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms