Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

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Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SGF29Q96ES7 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SGF29Q96ES7 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SGF29Q96ES7 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
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SGF29Q96ES7 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SGF29Q96ES7 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SGF29Q96ES7 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SGF29Q96ES7 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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SGF29Q96ES7 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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SGF29Q96ES7 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SGF29Q96ES7 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SGF29Q96ES7 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SGF29Q96ES7 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SGF29Q96ES7 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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SGF29Q96ES7 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SGF29Q96ES7 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SGF29Q96ES7 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
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