Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX8

RTP4, Receptor-transporting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP4Q96DX8 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.05■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RTP4Q96DX8 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RTP4Q96DX8 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RTP4Q96DX8 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RTP4Q96DX8 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RTP4Q96DX8 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RTP4Q96DX8 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RTP4Q96DX8 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RTP4Q96DX8 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RTP4Q96DX8 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
RTP4Q96DX8 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RTP4Q96DX8 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RTP4Q96DX8 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RTP4Q96DX8 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RTP4Q96DX8 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RTP4Q96DX8 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RTP4Q96DX8 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RTP4Q96DX8 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RTP4Q96DX8 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RTP4Q96DX8 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RTP4Q96DX8 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RTP4Q96DX8 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RTP4Q96DX8 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RTP4Q96DX8 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
RTP4Q96DX8 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RTP4Q96DX8 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms