Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

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Length 71 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SPTSSAQ969W0 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SPTSSAQ969W0 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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