Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP13Q92995 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP13Q92995 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP13Q92995 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP13Q92995 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP13Q92995 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP13Q92995 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP13Q92995 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP13Q92995 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
USP13Q92995 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP13Q92995 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP13Q92995 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP13Q92995 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP13Q92995 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
USP13Q92995 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
USP13Q92995 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP13Q92995 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP13Q92995 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP13Q92995 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP13Q92995 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP13Q92995 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP13Q92995 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP13Q92995 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP13Q92995 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP13Q92995 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP13Q92995 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP13Q92995 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP13Q92995 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP13Q92995 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP13Q92995 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP13Q92995 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP13Q92995 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
USP13Q92995 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP13Q92995 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
USP13Q92995 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP13Q92995 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP13Q92995 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
USP13Q92995 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP13Q92995 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP13Q92995 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
USP13Q92995 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
USP13Q92995 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP13Q92995 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP13Q92995 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP13Q92995 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP13Q92995 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
USP13Q92995 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP13Q92995 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP13Q92995 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP13Q92995 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP13Q92995 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
USP13Q92995 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP13Q92995 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP13Q92995 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP13Q92995 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP13Q92995 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP13Q92995 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP13Q92995 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP13Q92995 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP13Q92995 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP13Q92995 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP13Q92995 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP13Q92995 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP13Q92995 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP13Q92995 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP13Q92995 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP13Q92995 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP13Q92995 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP13Q92995 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP13Q92995 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP13Q92995 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP13Q92995 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP13Q92995 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP13Q92995 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP13Q92995 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP13Q92995 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP13Q92995 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP13Q92995 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP13Q92995 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP13Q92995 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP13Q92995 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP13Q92995 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
USP13Q92995 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
USP13Q92995 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP13Q92995 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP13Q92995 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP13Q92995 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
USP13Q92995 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP13Q92995 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP13Q92995 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP13Q92995 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP13Q92995 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
USP13Q92995 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP13Q92995 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP13Q92995 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP13Q92995 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP13Q92995 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
USP13Q92995 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
USP13Q92995 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP13Q92995 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms