Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXI2

CNKSR2, Connector enhancer of kinase suppressor of ras 2, humanhuman

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Length 1,034 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNKSR2Q8WXI2 LYZL6-201ENST00000615905 1047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNKSR2Q8WXI2 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNKSR2Q8WXI2 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNKSR2Q8WXI2 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNKSR2Q8WXI2 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNKSR2Q8WXI2 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNKSR2Q8WXI2 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNKSR2Q8WXI2 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNKSR2Q8WXI2 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNKSR2Q8WXI2 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNKSR2Q8WXI2 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNKSR2Q8WXI2 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNKSR2Q8WXI2 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNKSR2Q8WXI2 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNKSR2Q8WXI2 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNKSR2Q8WXI2 MFSD8-243ENST00000641695 1455 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CNKSR2Q8WXI2 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNKSR2Q8WXI2 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNKSR2Q8WXI2 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNKSR2Q8WXI2 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNKSR2Q8WXI2 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNKSR2Q8WXI2 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNKSR2Q8WXI2 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CNKSR2Q8WXI2 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNKSR2Q8WXI2 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNKSR2Q8WXI2 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNKSR2Q8WXI2 MORN4-201ENST00000307450 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNKSR2Q8WXI2 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNKSR2Q8WXI2 TAF12-202ENST00000373824 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNKSR2Q8WXI2 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CNKSR2Q8WXI2 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNKSR2Q8WXI2 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNKSR2Q8WXI2 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNKSR2Q8WXI2 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CNKSR2Q8WXI2 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNKSR2Q8WXI2 NPVF-201ENST00000222674 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNKSR2Q8WXI2 SF3B6-201ENST00000233468 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNKSR2Q8WXI2 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNKSR2Q8WXI2 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNKSR2Q8WXI2 SULT6B1-201ENST00000407963 902 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNKSR2Q8WXI2 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNKSR2Q8WXI2 LINC02089-201ENST00000412360 682 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNKSR2Q8WXI2 EPGN-202ENST00000413830 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNKSR2Q8WXI2 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNKSR2Q8WXI2 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNKSR2Q8WXI2 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNKSR2Q8WXI2 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNKSR2Q8WXI2 LINC00377-201ENST00000456588 657 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNKSR2Q8WXI2 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNKSR2Q8WXI2 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNKSR2Q8WXI2 LINC01633-201ENST00000566476 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNKSR2Q8WXI2 AC009167.1-201ENST00000568317 579 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNKSR2Q8WXI2 AC136443.4-201ENST00000568759 579 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNKSR2Q8WXI2 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNKSR2Q8WXI2 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNKSR2Q8WXI2 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNKSR2Q8WXI2 AL158042.1-201ENST00000605338 460 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CNKSR2Q8WXI2 NF1P10-201ENST00000613227 742 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CNKSR2Q8WXI2 C8orf59-210ENST00000614462 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNKSR2Q8WXI2 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CNKSR2Q8WXI2 ARG1-207ENST00000640973 708 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNKSR2Q8WXI2 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNKSR2Q8WXI2 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNKSR2Q8WXI2 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNKSR2Q8WXI2 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CNKSR2Q8WXI2 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNKSR2Q8WXI2 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNKSR2Q8WXI2 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNKSR2Q8WXI2 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNKSR2Q8WXI2 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNKSR2Q8WXI2 RCL1-206ENST00000442869 1644 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNKSR2Q8WXI2 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNKSR2Q8WXI2 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNKSR2Q8WXI2 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNKSR2Q8WXI2 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNKSR2Q8WXI2 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNKSR2Q8WXI2 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CNKSR2Q8WXI2 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNKSR2Q8WXI2 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNKSR2Q8WXI2 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNKSR2Q8WXI2 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNKSR2Q8WXI2 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNKSR2Q8WXI2 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNKSR2Q8WXI2 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNKSR2Q8WXI2 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNKSR2Q8WXI2 OR2J3-201ENST00000377169 1325 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNKSR2Q8WXI2 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNKSR2Q8WXI2 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNKSR2Q8WXI2 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNKSR2Q8WXI2 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNKSR2Q8WXI2 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNKSR2Q8WXI2 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNKSR2Q8WXI2 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNKSR2Q8WXI2 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNKSR2Q8WXI2 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNKSR2Q8WXI2 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNKSR2Q8WXI2 FRG1-201ENST00000226798 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNKSR2Q8WXI2 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNKSR2Q8WXI2 TMED6-201ENST00000288025 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CNKSR2Q8WXI2 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
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