Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4V2

SVOP, Synaptic vesicle 2-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVOPQ8N4V2 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 MYO15B-236ENST00000633867 6323 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 AHI1-201ENST00000265602 4335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 MGRN1-203ENST00000415496 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 UBFD1-207ENST00000567212 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 YWHAZ-206ENST00000395957 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 GOLGA7B-203ENST00000596005 6378 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 AC108359.1-201ENST00000616451 1211 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 HYOU1-220ENST00000617285 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 CNTLN-201ENST00000380641 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 RSBN1L-201ENST00000334955 6422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 HECTD1-203ENST00000553700 9080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 SESN3-203ENST00000536441 9558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SVOPQ8N4V2 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms