Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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TRAPPC6BQ86SZ2 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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TRAPPC6BQ86SZ2 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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TRAPPC6BQ86SZ2 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRAPPC6BQ86SZ2 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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TRAPPC6BQ86SZ2 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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TRAPPC6BQ86SZ2 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRAPPC6BQ86SZ2 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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