Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BHLHA9Q7RTU4 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms