Protein–RNA interactions for Protein: Q587J8

KHDC3L, KHDC3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC3LQ587J8 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
KHDC3LQ587J8 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
KHDC3LQ587J8 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
KHDC3LQ587J8 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
KHDC3LQ587J8 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
KHDC3LQ587J8 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
KHDC3LQ587J8 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
KHDC3LQ587J8 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
KHDC3LQ587J8 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
KHDC3LQ587J8 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
KHDC3LQ587J8 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
KHDC3LQ587J8 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
KHDC3LQ587J8 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
KHDC3LQ587J8 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
KHDC3LQ587J8 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
KHDC3LQ587J8 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
KHDC3LQ587J8 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
KHDC3LQ587J8 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
KHDC3LQ587J8 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
KHDC3LQ587J8 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
KHDC3LQ587J8 ARHGEF4-217ENST00000611048 3486 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
KHDC3LQ587J8 JADE1-209ENST00000511647 3560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
KHDC3LQ587J8 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
KHDC3LQ587J8 TCAF2-201ENST00000357344 2958 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
KHDC3LQ587J8 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
KHDC3LQ587J8 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
KHDC3LQ587J8 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
KHDC3LQ587J8 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
KHDC3LQ587J8 TMPRSS13-202ENST00000445164 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KHDC3LQ587J8 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
KHDC3LQ587J8 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KHDC3LQ587J8 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KHDC3LQ587J8 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KHDC3LQ587J8 MDM1-201ENST00000303145 2918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KHDC3LQ587J8 STRCP1-201ENST00000509801 5328 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
KHDC3LQ587J8 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KHDC3LQ587J8 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
KHDC3LQ587J8 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KHDC3LQ587J8 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
KHDC3LQ587J8 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
KHDC3LQ587J8 NTSR1-201ENST00000370501 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KHDC3LQ587J8 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
KHDC3LQ587J8 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KHDC3LQ587J8 SLC45A1-201ENST00000289877 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KHDC3LQ587J8 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KHDC3LQ587J8 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KHDC3LQ587J8 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KHDC3LQ587J8 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
KHDC3LQ587J8 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KHDC3LQ587J8 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
KHDC3LQ587J8 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KHDC3LQ587J8 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KHDC3LQ587J8 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KHDC3LQ587J8 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
KHDC3LQ587J8 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KHDC3LQ587J8 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KHDC3LQ587J8 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
KHDC3LQ587J8 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KHDC3LQ587J8 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
KHDC3LQ587J8 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KHDC3LQ587J8 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KHDC3LQ587J8 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC11.87□□□□□ -0.51
KHDC3LQ587J8 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
KHDC3LQ587J8 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
KHDC3LQ587J8 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
KHDC3LQ587J8 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KHDC3LQ587J8 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
KHDC3LQ587J8 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KHDC3LQ587J8 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
KHDC3LQ587J8 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
KHDC3LQ587J8 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KHDC3LQ587J8 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
KHDC3LQ587J8 C1orf109-201ENST00000358011 2355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
KHDC3LQ587J8 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
KHDC3LQ587J8 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KHDC3LQ587J8 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KHDC3LQ587J8 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KHDC3LQ587J8 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KHDC3LQ587J8 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
KHDC3LQ587J8 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
KHDC3LQ587J8 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KHDC3LQ587J8 GRM4-203ENST00000455714 2574 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
KHDC3LQ587J8 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KHDC3LQ587J8 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
KHDC3LQ587J8 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KHDC3LQ587J8 MBP-208ENST00000397866 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KHDC3LQ587J8 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KHDC3LQ587J8 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KHDC3LQ587J8 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KHDC3LQ587J8 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KHDC3LQ587J8 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KHDC3LQ587J8 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
KHDC3LQ587J8 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
KHDC3LQ587J8 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KHDC3LQ587J8 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KHDC3LQ587J8 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
KHDC3LQ587J8 PCDHB10-201ENST00000239446 3290 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
KHDC3LQ587J8 ZFAND3-201ENST00000287218 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
KHDC3LQ587J8 VENTXP1-201ENST00000569334 2716 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
KHDC3LQ587J8 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.5 ms