Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY46

KRTAP13-3, Keratin-associated protein 13-3, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP13-3Q3SY46 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
KRTAP13-3Q3SY46 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms