Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCDC96Q2M329 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC96Q2M329 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms