Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

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Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CSPP1Q1MSJ5 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
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