Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 SEZ6L-201ENST00000248933 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 SEZ6L-210ENST00000629590 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 ZNF410-201ENST00000324593 2293 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 MALL-201ENST00000272462 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 TMEM57-201ENST00000374343 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 NHEJ1-201ENST00000356853 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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CTF1Q16619 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
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CTF1Q16619 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 HERPUD1-204ENST00000439977 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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CTF1Q16619 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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CTF1Q16619 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
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CTF1Q16619 PDE4A-204ENST00000440014 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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CTF1Q16619 CT62-203ENST00000566432 2822 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
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CTF1Q16619 PDE9A-201ENST00000291539 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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CTF1Q16619 TMBIM1-202ENST00000396809 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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CTF1Q16619 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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CTF1Q16619 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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CTF1Q16619 AGGF1P10-201ENST00000635005 2191 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
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CTF1Q16619 C1orf109-201ENST00000358011 2355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 CD22-209ENST00000594250 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CTF1Q16619 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 DNAJA4-203ENST00000394855 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 NAGK-202ENST00000418807 2343 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 GCOM1-214ENST00000587652 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 ZBED8-201ENST00000408953 2851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 LINC00567-201ENST00000569854 3409 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 MYRIP-203ENST00000425621 2981 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 SPATS2-201ENST00000321898 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 TRIM40-207ENST00000396581 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 SAP30BP-225ENST00000584667 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 CDK5RAP1-203ENST00000357886 2164 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CTF1Q16619 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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