Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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ZNF239Q16600 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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ZNF239Q16600 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF239Q16600 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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