Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.31
SSX1Q16384 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
SSX1Q16384 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
SSX1Q16384 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.31
SSX1Q16384 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SSX1Q16384 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SSX1Q16384 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SSX1Q16384 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SSX1Q16384 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SSX1Q16384 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SSX1Q16384 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SSX1Q16384 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SSX1Q16384 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SSX1Q16384 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SSX1Q16384 ENG-202ENST00000373203 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SSX1Q16384 C3orf18-206ENST00000449241 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SSX1Q16384 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SSX1Q16384 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SSX1Q16384 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SSX1Q16384 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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SSX1Q16384 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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SSX1Q16384 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SSX1Q16384 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SSX1Q16384 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SSX1Q16384 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SSX1Q16384 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SSX1Q16384 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
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SSX1Q16384 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SSX1Q16384 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SSX1Q16384 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SSX1Q16384 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SSX1Q16384 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SSX1Q16384 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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SSX1Q16384 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SSX1Q16384 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SSX1Q16384 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SSX1Q16384 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SSX1Q16384 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SSX1Q16384 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SSX1Q16384 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SSX1Q16384 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SSX1Q16384 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SSX1Q16384 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SSX1Q16384 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SSX1Q16384 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SSX1Q16384 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SSX1Q16384 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SSX1Q16384 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SSX1Q16384 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SSX1Q16384 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SSX1Q16384 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SSX1Q16384 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SSX1Q16384 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SSX1Q16384 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SSX1Q16384 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SSX1Q16384 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SSX1Q16384 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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