Protein–RNA interactions for Protein: Q15642

TRIP10, Cdc42-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP10Q15642 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 CTBP1-AS-201ENST00000625256 3886 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 TRIM4-203ENST00000355947 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 LHFPL2-201ENST00000380345 5043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRIP10Q15642 NTNG1-204ENST00000370067 4628 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms