Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 BRSK2-207ENST00000528710 3528 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RAB39AQ14964 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.7 ms