Protein–RNA interactions for Protein: Q14957

GRIN2C, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, humanhuman

Predictions only

Length 1,233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2CQ14957 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 CALCA-205ENST00000486207 851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 AC023906.1-201ENST00000486386 453 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 AC009779.3-204ENST00000549424 367 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 USB1-205ENST00000561743 1135 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 ODF3L1-201ENST00000332145 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 CFAP36-203ENST00000403007 759 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 AC114812.1-201ENST00000421868 689 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 AL512622.1-202ENST00000443922 478 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 VENTXP4-201ENST00000449029 958 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 CHTF8-207ENST00000520529 475 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 AF111169.3-201ENST00000553991 756 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 AC018846.1-201ENST00000568231 183 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 AP005899.1-201ENST00000579467 544 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 LAMP5-202ENST00000427562 1309 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.9 ms