Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 UMODL1-205ENST00000408910 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 JADE1-209ENST00000511647 3560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 LRRC8A-203ENST00000372600 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 RAPGEF6-207ENST00000507093 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 GFRA1-204ENST00000439649 9216 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 CHL1-201ENST00000256509 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 SCN1B-202ENST00000415950 4537 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 FGFR1-211ENST00000425967 5375 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 STARD8-203ENST00000374599 4841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 WNK1-202ENST00000340908 11208 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 DFFA-202ENST00000377038 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 FAM225A-202ENST00000453010 5625 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 PHF20-203ENST00000374012 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 PTPRK-207ENST00000368226 6087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 PIK3CD-202ENST00000377346 5203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 SYBU-204ENST00000408908 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 NCLN-201ENST00000246117 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 SLIT2-204ENST00000504154 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 SMTN-203ENST00000358743 3198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 XIRP1-201ENST00000340369 6460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 ADD2-202ENST00000355733 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 USP20-201ENST00000315480 4458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 MEF2D-204ENST00000464356 5598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
SMCO1Q147U7 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
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