Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
GTF2H3Q13889 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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