Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MTMR3Q13615 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
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