Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 AC040160.2-201ENST00000623816 1675 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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CLN3Q13286 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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CLN3Q13286 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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CLN3Q13286 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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CLN3Q13286 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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CLN3Q13286 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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CLN3Q13286 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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CLN3Q13286 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 AC084048.1-201ENST00000505494 640 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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