Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms