Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

Predictions only

Length 1,337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPRJQ12913 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 198.4 ms