Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
STX4Q12846 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
STX4Q12846 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
STX4Q12846 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
STX4Q12846 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
STX4Q12846 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
STX4Q12846 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
STX4Q12846 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
STX4Q12846 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
STX4Q12846 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
STX4Q12846 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
STX4Q12846 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
STX4Q12846 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
STX4Q12846 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
STX4Q12846 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
STX4Q12846 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
STX4Q12846 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
STX4Q12846 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
STX4Q12846 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
STX4Q12846 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
STX4Q12846 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
STX4Q12846 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
STX4Q12846 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
STX4Q12846 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
STX4Q12846 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
STX4Q12846 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
STX4Q12846 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
STX4Q12846 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
STX4Q12846 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
STX4Q12846 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
STX4Q12846 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
STX4Q12846 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
STX4Q12846 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
STX4Q12846 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
STX4Q12846 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
STX4Q12846 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
STX4Q12846 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
STX4Q12846 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
STX4Q12846 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
STX4Q12846 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
STX4Q12846 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
STX4Q12846 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
STX4Q12846 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
STX4Q12846 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC14.1□□□□□ -0.15
STX4Q12846 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
STX4Q12846 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
STX4Q12846 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
STX4Q12846 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
STX4Q12846 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
STX4Q12846 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
STX4Q12846 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
STX4Q12846 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
STX4Q12846 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
STX4Q12846 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
STX4Q12846 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
STX4Q12846 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
STX4Q12846 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
STX4Q12846 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
STX4Q12846 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
STX4Q12846 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
STX4Q12846 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
STX4Q12846 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
STX4Q12846 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
STX4Q12846 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
STX4Q12846 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
STX4Q12846 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
STX4Q12846 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
STX4Q12846 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
STX4Q12846 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
STX4Q12846 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
STX4Q12846 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
STX4Q12846 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
STX4Q12846 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
STX4Q12846 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
STX4Q12846 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
STX4Q12846 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
STX4Q12846 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
STX4Q12846 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
STX4Q12846 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
STX4Q12846 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
STX4Q12846 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
STX4Q12846 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
STX4Q12846 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
STX4Q12846 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
STX4Q12846 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
STX4Q12846 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
STX4Q12846 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
STX4Q12846 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
STX4Q12846 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
STX4Q12846 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
STX4Q12846 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
STX4Q12846 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
STX4Q12846 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
STX4Q12846 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
STX4Q12846 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
STX4Q12846 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
STX4Q12846 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
STX4Q12846 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
STX4Q12846 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
STX4Q12846 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms