Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TROQ12816 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TROQ12816 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TROQ12816 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TROQ12816 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TROQ12816 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TROQ12816 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TROQ12816 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TROQ12816 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TROQ12816 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TROQ12816 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TROQ12816 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TROQ12816 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TROQ12816 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TROQ12816 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TROQ12816 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TROQ12816 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TROQ12816 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TROQ12816 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TROQ12816 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TROQ12816 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TROQ12816 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TROQ12816 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TROQ12816 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TROQ12816 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TROQ12816 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TROQ12816 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TROQ12816 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TROQ12816 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TROQ12816 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TROQ12816 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TROQ12816 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TROQ12816 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TROQ12816 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TROQ12816 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TROQ12816 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TROQ12816 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TROQ12816 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TROQ12816 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TROQ12816 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TROQ12816 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TROQ12816 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TROQ12816 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TROQ12816 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TROQ12816 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TROQ12816 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TROQ12816 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TROQ12816 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TROQ12816 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TROQ12816 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TROQ12816 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TROQ12816 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TROQ12816 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TROQ12816 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TROQ12816 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TROQ12816 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TROQ12816 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TROQ12816 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TROQ12816 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TROQ12816 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TROQ12816 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TROQ12816 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TROQ12816 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TROQ12816 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TROQ12816 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TROQ12816 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TROQ12816 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TROQ12816 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TROQ12816 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TROQ12816 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TROQ12816 USB1-205ENST00000561743 1135 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TROQ12816 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TROQ12816 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TROQ12816 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TROQ12816 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TROQ12816 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TROQ12816 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TROQ12816 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TROQ12816 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TROQ12816 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TROQ12816 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TROQ12816 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TROQ12816 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TROQ12816 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TROQ12816 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TROQ12816 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TROQ12816 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TROQ12816 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TROQ12816 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TROQ12816 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TROQ12816 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TROQ12816 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TROQ12816 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TROQ12816 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TROQ12816 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TROQ12816 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TROQ12816 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TROQ12816 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TROQ12816 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TROQ12816 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
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