Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC15Q0P6D6 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms