Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNB2Q08289 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms