Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOX4Q06945 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOX4Q06945 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOX4Q06945 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOX4Q06945 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOX4Q06945 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOX4Q06945 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOX4Q06945 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOX4Q06945 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOX4Q06945 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOX4Q06945 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOX4Q06945 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOX4Q06945 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOX4Q06945 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOX4Q06945 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOX4Q06945 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOX4Q06945 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOX4Q06945 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOX4Q06945 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOX4Q06945 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOX4Q06945 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SOX4Q06945 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SOX4Q06945 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SOX4Q06945 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SOX4Q06945 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SOX4Q06945 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SOX4Q06945 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SOX4Q06945 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SOX4Q06945 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SOX4Q06945 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SOX4Q06945 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SOX4Q06945 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SOX4Q06945 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SOX4Q06945 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SOX4Q06945 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SOX4Q06945 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SOX4Q06945 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SOX4Q06945 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SOX4Q06945 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SOX4Q06945 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SOX4Q06945 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SOX4Q06945 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SOX4Q06945 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SOX4Q06945 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SOX4Q06945 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SOX4Q06945 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SOX4Q06945 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SOX4Q06945 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SOX4Q06945 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SOX4Q06945 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SOX4Q06945 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SOX4Q06945 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SOX4Q06945 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SOX4Q06945 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SOX4Q06945 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SOX4Q06945 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SOX4Q06945 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SOX4Q06945 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SOX4Q06945 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SOX4Q06945 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SOX4Q06945 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SOX4Q06945 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SOX4Q06945 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SOX4Q06945 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SOX4Q06945 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SOX4Q06945 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SOX4Q06945 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SOX4Q06945 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SOX4Q06945 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SOX4Q06945 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SOX4Q06945 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SOX4Q06945 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SOX4Q06945 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SOX4Q06945 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SOX4Q06945 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SOX4Q06945 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SOX4Q06945 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SOX4Q06945 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SOX4Q06945 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SOX4Q06945 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SOX4Q06945 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SOX4Q06945 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SOX4Q06945 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SOX4Q06945 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SOX4Q06945 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SOX4Q06945 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SOX4Q06945 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SOX4Q06945 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SOX4Q06945 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SOX4Q06945 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SOX4Q06945 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SOX4Q06945 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SOX4Q06945 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SOX4Q06945 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SOX4Q06945 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SOX4Q06945 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SOX4Q06945 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SOX4Q06945 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SOX4Q06945 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SOX4Q06945 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms