Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 C15orf39-207ENST00000567617 4249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 ZNF571-AS1-203ENST00000586139 2684 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 PES1-205ENST00000405677 2708 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 CSTF2-203ENST00000415585 2074 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 ZFYVE19-209ENST00000564258 2059 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 KIF9-207ENST00000444589 2791 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 AC010547.1-201ENST00000500612 2793 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 MYO1D-206ENST00000579584 3500 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 CHTF18-201ENST00000262315 3090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 SLC6A9-205ENST00000372310 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 EPHA1-201ENST00000275815 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 RNF219-AS1-209ENST00000606429 2418 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 AC092117.1-201ENST00000621230 3250 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 LINC00846-201ENST00000334165 1778 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC12.8□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 BNIP3L-201ENST00000380629 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 KRT42P-202ENST00000438131 2895 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 TMEM25-208ENST00000524725 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 DLGAP2-201ENST00000421627 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 DPY19L2P2-205ENST00000439473 3994 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 HPSE2-202ENST00000370549 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 SP7-201ENST00000303846 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 SLC45A2-202ENST00000382102 2723 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 SMG8-202ENST00000543872 3477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 MCU-204ENST00000536019 3224 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 NUTM2A-AS1-208ENST00000446751 2394 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 BAIAP3-203ENST00000421665 3875 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 HYOU1-220ENST00000617285 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 AC112176.1-201ENST00000565428 3024 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 AL031687.1-201ENST00000450586 2137 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 NEK11-209ENST00000510688 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 RCAN2-204ENST00000405162 2457 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 NEU3-204ENST00000531509 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 CLINT1-201ENST00000411809 3440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 ATP2C1-221ENST00000513801 3439 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
IFITM3Q01628 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.9 ms