Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 TJAP1-204ENST00000372449 2695 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 TJAP1-205ENST00000372452 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 SLC8A3-205ENST00000394330 2622 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 FTO-214ENST00000636218 2227 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 HNRNPH1-202ENST00000356731 3667 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC12.38□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 STRCP1-201ENST00000509801 5328 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC12.38□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC12.38□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC12.38□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC12.38□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 ASXL1-201ENST00000306058 6591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 BTRC-202ENST00000370187 6134 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 ABI2-201ENST00000261016 6634 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 MYNN-201ENST00000349841 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 TRIM80P-201ENST00000455685 2848 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 HYOU1-220ENST00000617285 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 SMC4-202ENST00000357388 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 C10orf105-202ENST00000441508 4836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 SLC35F2-203ENST00000525071 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
DEFA6Q01524 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms