Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
IRX1P78414 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
IRX1P78414 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
IRX1P78414 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
IRX1P78414 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
IRX1P78414 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
IRX1P78414 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
IRX1P78414 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
IRX1P78414 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
IRX1P78414 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
IRX1P78414 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
IRX1P78414 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
IRX1P78414 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
IRX1P78414 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
IRX1P78414 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
IRX1P78414 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
IRX1P78414 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
IRX1P78414 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
IRX1P78414 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
IRX1P78414 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
IRX1P78414 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
IRX1P78414 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
IRX1P78414 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
IRX1P78414 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
IRX1P78414 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
IRX1P78414 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
IRX1P78414 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
IRX1P78414 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
IRX1P78414 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
IRX1P78414 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
IRX1P78414 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
IRX1P78414 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
IRX1P78414 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
IRX1P78414 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
IRX1P78414 CCDC88C-201ENST00000331194 3104 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
IRX1P78414 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
IRX1P78414 CYTH1-215ENST00000591455 3286 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
IRX1P78414 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
IRX1P78414 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
IRX1P78414 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
IRX1P78414 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
IRX1P78414 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
IRX1P78414 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
IRX1P78414 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
IRX1P78414 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
IRX1P78414 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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IRX1P78414 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
IRX1P78414 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
IRX1P78414 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
IRX1P78414 TKT-203ENST00000423525 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
IRX1P78414 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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IRX1P78414 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
IRX1P78414 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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IRX1P78414 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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IRX1P78414 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
IRX1P78414 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
IRX1P78414 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
IRX1P78414 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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IRX1P78414 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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IRX1P78414 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
IRX1P78414 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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IRX1P78414 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
IRX1P78414 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
IRX1P78414 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
IRX1P78414 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
IRX1P78414 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
IRX1P78414 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
IRX1P78414 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
IRX1P78414 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
IRX1P78414 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
IRX1P78414 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
IRX1P78414 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
IRX1P78414 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
IRX1P78414 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
IRX1P78414 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
IRX1P78414 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
IRX1P78414 C17orf53-203ENST00000585683 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
IRX1P78414 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
IRX1P78414 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
IRX1P78414 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
IRX1P78414 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
IRX1P78414 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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